به‌وسیله‌ی روش Amino acid Analysis می‌توان هویت و ترکیب اسید‌آمینه‌ای یک پروتئین، پپتید یا دارو را تعیین کرد. کوچک‌ترین تغییر در هر کدام‌یک از این مولکول‌ها می‌تواند عملکرد واقعی آن‌ها را تغییر دهد. این موضوع به‌خصوص اگر با داروهای انسانی سروکار داشته باشیم اهمیت مضاعفی پیدا می‌کند؛ اما آمینواسیدها را نمی‌توان به‌راحتی تشخیص داد چون آمینواسیدها کرموموفرهای طبیعی ندارند (برای حل این مشکل از مشتق‌سازی استفاده می‌شود یعنی ماده‌ای که فلورسنت باشد به آن اضافه می‌کنند).