شناسایی و تعیین ویژگی پروتئین به منظور های مختلفی در علوم زیستی کاربرد دارد و اهمیت پیدا کرده است. از جمله این اهداف می توان به تایید حضور یک پروتئین خاص، تعیین ساختار پروتئین، تعیین وزن مولکولی، تعیین نقطه ی ایزوالکتریک و… اشاره نمود. این تعیین ویژگی ها می تواند به منظور پیشگیری، تشخیص و درمان بیماری ها و توسعه ی فناوری های مرتبط با آن ها صورت بگیرد.