هدف از تجزیه و تحلیل عوامل داخلی (نقاط قوت و ضعف sw) و عوامل خارجی (فرصتها و تهدیدات OT) یک کشور با یک سازمان این است که تمام واقعیت ها و اطلاعات مربوط به محیط درونی و نیز محیط بیرونی در بر گیرنده آنها مورد ملاحظه فرار گیرد تا تصویر روشن تری از وضعیت موجود کشور و نیز وضعیت مطلوبی که می توان به آن رسید، به دست آید. اما به دلیل گستردگی دامنه اطلاعات، در طرح ریزی راهبردی امکان دسترسی به اطلاعات کامل وجود ندارد و نمی توان همه اطلاعات مورد نیاز برای تجزیه و تحليل SWOT و توصیه های لازم را ارائه نمود. بنابر این بسیاری از اطلاعاتی که در تجزیه و تحليل SWOT در این طرح ریزی استفاده شده، واقعیت های پذیرفته می باشند، اما سایر اطلاعات در چارچوب عقاید، نظریه ها، باورها، قضاوتها و پیش فرضهای معقول به جای مجهولات، و به چای اطلاعاتی که دسترسی به آنها دشوار است، به کار گرفته شده اند.

منظور از محیط داخلی با درونی، عوامل داخلی سازمانها و مراکز تحقیقاتی زیست فناوری و عوامل مرتبط با فعالیتهای این سازمانها در سطح ملی است. منظور از عوامل خارجی نیز اطلاعات خارج از محیط ملی و در سطح بین المللی است که به طور مستقیم و غیرمستقیم بر روی فعالیتهای تحقیقاتی زیست فناوری ایران تاثیر می گذارد.

باید کشورها، سازمانها و نهادها برای گزینش واکنش های کار ساز – از مبان تغییراتی که در محیط های آنها رخ می دهد . به طور مستمر محیط های داخلی و خارجی خود را مورد تجزیه و تحلیل و ارزیابی قرار دهند. هر کشور با سازمان نیز باید به دقت مراقب رویدادها و تحولات باشد و مشاهدات خود را تفسیر نماید.

این تجزیه و تحلیل بر مبنای مدل Sowt در دو مرحله (عمودی و افقی) و در نتیجه ارزیابی هریک از این عوامل داخلی و خارجی در ابعاد قدرت ملی (سیاسی، اقتصادی، اجتماعی، فرهنگی و دفاعی – امنیتی)، انجام گرفته است تا گزینه هایی برای ارتقای وضعیت کنونی زیست فناوری به وضعیتی مطلوب، ارائه شود.