ساختار صفرم: ساختار عددی می باشد و چیزهایی که به صورت یک عدد می باشد را می گویند .مثل PI وزن مولکولی ، amino acid composition، atomic composition

ساختار اولیه : همان سکانس و توالی اسیدآمینه ای می باشد.

ساختار ثانویه : ساختار مارپیچ helix وβ-sheet و β-strand می باشد .

ساختار سوم : شکل فضایی سه بعدی

ساختار چهارم : وقتی که پروتئین از چند زیر واحد تشکیل ساخته شده باشد.

ساختار پنجم : ساختارهای نانویی را می گویند .